Código de Barra de la Vida

Objetivo

Familiarizar a los participantes con los objetivos del proyecto internacional Los Códigos de Barras de la Vida, así como conocer el manejo de la base de datos BOLD.

Objetivos Particulares

1.- Aprender el manejo, fijación y preparación de muestras para obtención de ADN

2.- Labor curatorial de los especímenes

3.- Apertura de proyectos individuales en BOLD. Introducción de datos curatoriales, imágenes y secuencias.

4.- Uso de BOLD para

-Identificación de especímenes desconocidos

-Manejo de datos de secuencias (divergencias genéticas)

-Trabajo colaborativo

Dirigido a:

Personal interesado en la biodiversidad y su estudio con taxonomía integrativa

Temario

1.- La taxonomía integrativa en el siglo XXI

2.- Obtención de muestras y preparación para el trabajo con ADN

3.- Toma de tejidos, fijación y conservación de los mismos

4.- Llenado de bases de datos

5.- Obtención de una cuenta en BOLD

6.- Apertura de un proyecto en la base de datos BOLD. Características asignadas al proyecto. Trabajo colaborativo.

8.- Página inicial del proyecto. Indicadores de avance.

9.- Introducción de datos en BOLD. Datos curatoriales. Forma de someter los datos.

10.- Procesamiento de las muestras de tejidos. 

-Principios básicos de la extracción del ADN

-PCR (Reacción en cadena de la polimerasa). Uso de iniciadores (primers) específicos. Grupos con problemas para el PCR

-Visualización de productos PCR. Uso de geles en gran escala

-Limpieza del PCR

-Secuenciación

-Manejo de datos a partir del secuenciador. Principios de alineación de las secuencias.

11.- Subir datos de secuencias y electroferogramas (archivos traza) en BOLD

12.- Corrección de datos en el sistema: Datos curatoriales y secuencias.

13.- Control de calidad de las secuencias y de los datos generados por el secuenciador.

14.- Manejo de los datos, obtención de datos en Excel, árboles de identidad y secuencias.

15.- Publicación de un proyecto.

16.- Realizar identificación de secuencias desconocidas

17.- Navegador taxonómico y combinación de proyectos

18.- Biorepositorios y su importancia para BOLD.

19.- Conclusiones generales y discusión sobre las formas de participación.

 

Ponentes

Martha Valdez 

Bióloga y Maestra en Ciencias en Biología Animal por la Universidad Nacional Autónoma de México, Doctora en Ciencias con la especialidad en Zoología por la Universidad Autónoma de Nuevo León, donde obtuvo el Summa Cum Laude. Profesora en la Facultad de Estudios Superiores Iztacala de 1987 a 1997, donde fue corresponsable del Acuario “Juan Luis Cifuentes Lemus”. Actualmente es Investigadora de tiempo completo en ECOSUR, adscrita a la línea de investigación de necton.

 

Su investigación se ha enfocado al estudio de la osteología de peces, especialmente de los carácidos y grupos afines, con fines de la obtención de nuevos caracteres taxonómicos más precisos y su aplicación en sistemática. Actualmente se encuentra desarrollando una estancia sabática en la Universidad de Guelph (Canadá) para desarrollar técnicas de taxonomía molecular en peces mexicanos y de Centroamérica.

Manuel Elías Gutiérrez 

Biólogo por la Universidad Nacional Autónoma de México, Maestro en Ciencias y Doctor en Ciencias por el Instituto Politécnico Nacional, con la especialidad en Ecología Acuática. Su tema de investigación actualmente es sobre taxonomía y ecología del zooplancton de aguas dulces, con énfasis en la región sureste de nuestro país. Ha participado en la descripción de cinco especies, un género y dos subespecies de cladóceros, dos especies y una subfamilia de copépodos, todas ellas nuevas para la ciencia y procedentes de aguas mexicanas. Ha participado como autor o coautor en más de 50 artículos científicos en revistas indexadas, 8 capítulos de libro y dos libros. Profesor de Zoología de la Facultad de Estudios Superiores Iztacala (UNAM) desde 1980 hasta 1997, donde recibió la distinción al mérito académico. Desde 1997 a la fecha es investigador de tiempo completo en el ECOSUR.

 

Especialista en taxonomía y ecología del zooplancton, principalmente microcrustáceos como los cladóceros y copépodos, aunque también ha desarrollado algunos trabajos con rotíferos. Desde 1996 a la fecha ha realizado un inventario de las especies presentes en México, en particular para las regiones del altiplano y sureste, así como las condiciones ecológicas en que se desarrollan. Actualmente ha iniciado estudios sobre biología molecular aplicados en taxonomía del zooplancton dulceacuícola.

Fecha y Horario

26 al 29 de Febrero del 2024 / 12:00 pm a 6:00 pm 

Costo

Comunidad FCB $1000.00 pesos (Alumnos y Profesores)

Comunidad UANL $1250.00 pesos 

Externos y Egresados $1500.00 pesos 

Inscripciones

21 y 22 de febrero del 2024 en el Centro de Resguardo para Peces en Peligro de Extinción